合成致死新靶點——WRN細(xì)胞模型
發(fā)布時間:2025/11/13分類:技術(shù)文章來源:科佰生物
背景
“合成致死”是指兩個非致死基因同時被抑制,導(dǎo)致細(xì)胞死亡的現(xiàn)象。當(dāng)兩個基因同時失活導(dǎo)致細(xì)胞死亡,但任一基因中的單獨失活都是無明顯毒性。在發(fā)生突變失活的腫瘤中,通過抑制其合成致死配對基因,可獲得腫瘤選擇性殺死。

PARP抑制劑是全球首個利用合成致死理論成功研發(fā)并在臨床實踐中取得成功的藥物。從2014年首款PARP抑制劑奧拉帕利獲FDA批準(zhǔn)到現(xiàn)在,已有近10年的時間,但目前尚無針對其他靶點的“合成致死”藥物獲批。


國際頂級期刊之一Nature于去年同一天上線了兩篇關(guān)于WRN(Werner綜合征RecQ解旋酶)抑制劑的文章,其中一篇是關(guān)于Novartis的HRO761的發(fā)現(xiàn)過程,另一篇介紹了拜耳(Bayer)旗下Vividion Therapeutics 公司的VVD-133214 (又叫RO7589831)的發(fā)現(xiàn)過程。這些文章重燃了醫(yī)藥行業(yè)對“WRN”這個合成致死靶點的關(guān)注。

WRN的結(jié)構(gòu)及其功能
WRN(Werner Helicase)是一種具有解旋酶和核酸外切酶活性的多功能酶,在維持基因組穩(wěn)定性至關(guān)重要的各種細(xì)胞過程中發(fā)揮作用,包括 DNA 復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、DNA 修復(fù)和端粒維護(hù)。

WRN 缺失會導(dǎo)致細(xì)胞周期停滯、DNA 損傷、有絲分裂缺陷、染色體破碎和細(xì)胞凋亡,特別是在 MSI 細(xì)胞中。此外,WRN 敲除減少了移植 MSI(微衛(wèi)星不穩(wěn)定性)細(xì)胞的小鼠的異種移植物生長和腫瘤形成。引人注目的是,各種 MMR(DNA 錯配修復(fù)) 成分的急性消耗并沒有誘導(dǎo) MSS(微衛(wèi)星穩(wěn)定)細(xì)胞對 WRN 的依賴。相反,在MSI細(xì)胞中重新引入缺失的MMR成分的基因拯救實驗未能拯救合成致死關(guān)系。這些實驗表明,WRN 合成致死關(guān)系是通過 MMR 功能障礙的突變后果而不是通過 MMR 缺陷本身來發(fā)展的。此外,使用解旋酶結(jié)構(gòu)域、核酸外切酶結(jié)構(gòu)域或兩者內(nèi)的功能喪失突變對 WRN 的各種酶活性進(jìn)行剖析,證明 MSI 細(xì)胞中的WRN 依賴性僅與其解旋酶功能有關(guān)。
WRN的細(xì)胞模型
目前全球沒有靶向WRN的藥物獲批上市,進(jìn)展最快的是開頭提到的拜耳旗下公司的VVD-133214和諾華的HRO761。VVD-133214是一款WRN共價變構(gòu)抑制劑,能夠選擇性地與WRN上的C727位點結(jié)合。諾華的HRO761是一款非共價別構(gòu)WRN抑制劑,可在D1和D2解旋酶結(jié)構(gòu)域的界面上變構(gòu)結(jié)合,從而將WRN鎖定在非活性構(gòu)象中。HRO761還以劑量依賴的方式誘導(dǎo)WRN降解,激活DNA損傷反應(yīng)并誘導(dǎo)p53靶基因。
除了以上兩款臨床階段的WRN藥物外,還有多款處于臨床前階段的靶向WRN的藥物,如英矽智能的SM9432A和ISM2196、勤浩醫(yī)藥的GH1581、先聲再明的ZM-3329和浦合醫(yī)藥的PH027等等。此外,葛蘭素史克(GSK)、Eikon Therapeutics公司、Syros Pharmaceuticals公司和Nimbus Therapeutics公司等也有研究該靶點。
為了助力WRN藥物的研發(fā),科佰生物開發(fā)了基于基因編輯的WRN細(xì)胞模型,用于候選藥物早期機理研究。結(jié)果如下:
數(shù)據(jù)展示
WRN[C727A](Heterozygous,AF%:50) Isogenic HCT116 CBP75082

Figure 6. CTG Proliferation Assay of WRN[C727A](Heterozygous,AF%:50) Isogenic HCT116(1C12C6).

Figure 7. CTC Proliferation Assay of WRN[C727A](Heterozygous,AF%:50) lsogenic HCT116(1C12C6).
WRN[C727A](Homozygous,AF%:100) Isogenic HCT116 CBP75081

Figure 8. CTG Proliferation Assays of WRN[C727A](Homozygous,AF%:100) Isogenic HCT116(1C22).

Figure 9. CTG Proliferation Assays of WRN[C727A](Homozygous,AF%:100) Isogenic HCT116(1C22).